稳定同位素示踪技术(SIP)

发表日期:2024-03-19

DNA稳定同位素示踪(DNA-Stable Isotope Probing)是一种用于追踪鉴定将特定碳源和营养物质同化为细胞生物质的活性微生物的技术。这种独立于栽培的技术是标记生存在各种陆地和水生环境中的具有特定代谢功能群落的重要方法。在用稳定同位素标记的化合物培育环境样品后,提取的核酸进行密度梯度超速离心和随后的梯度分馏以分离不同密度的核酸。从氯化铯中纯化DNA后可检索标记和未标记的DNA,用于随后的分子表征(例如指纹识别,微阵列,克隆文库,宏基因组学,基因测序等)。

此外,团队开发了SIP-宏基因组-单菌草图组装技术联用平台,不光能够鉴定厌氧砷氧化菌的种属,还能够发现参与砷氧化的功能基因及其它关键基因,同时在菌株水平上,进行基因和功能注释,揭示代谢功能基因,预测相关功能蛋白。能够从群落到种群直到菌株水平上,揭示厌氧砷氧化的微生物机制。

本技术包含的核心专利:一种判别土壤中参与锑还原过程的菌种及其关键功能基因的方法(专利号:ZL 2019 1 0539841.2)

持有单位:广东省科学院生态环境与土壤研究所

持有团队:土壤生态修复团队

联系人:孙蔚旻

联系电话:18826281972

电子邮箱:wmsun@soil.gd.cn


定同位素示踪平台