近年来，研究所承担国家交流合作项目19项，目前在研国际合作项目13项，包括国家基金委国际合作项目2项，APN亚太全球变化研究组织资助的国际区域性合作项目1项，科技部引进高端外国专家项目6项，广东省银龄专家1项、海外名师1项，省级对外科技合作平台项目1项，广东省科学院国际合作项目1项，涉及到7个国家，美国、日本等发达国家及一带一路发展中国家。代表性国际合作项目如下：

（1）与美国罗格斯大学合作申报，于2014年获批了重点国际（地区）合作研究项目“红壤区稻田铁循环耦合镉行为的生物地球化学机制”，通过国际合作项目的开展，与国外一流大学形成了实质性的合作关系。

（2）与英国约克大学、Aberdeen大学共同承担了中英重大国际合作研究计划项目“红壤关键带铁循环耦合碳氮转化过程及其生态功能”：项目于2016年开始启动，在江西鹰潭红壤站实施，在红壤元素循环领域取得了国际领先的创新性成果。

（3）依托广东省科学院引进创新团队项目“土壤环境技术创新团队”，引进美国罗格斯大学副校长、美国科学促进会会士，美国微生物学会院士Lily L. Young教授为首的创新团队，在土壤微生物领域，与美国罗格斯大学形成了全面深入的合作关系。

（4）依托广东省科学院国家科技合作引导专项“中国-泰国林下侵蚀机理与防控技术参比研究”，在土壤侵蚀与水土保持领域，与泰国土地开发司进一步加强合作交流，深入与一带一路沿线国家合作。

（更新时间：2023年12月）